石斛營養價值雖然比較高，但是目前體內濕氣情況比較重，或是目前存懷孕的情況，則不建議服用石斛，否則可能會因此引起流產等現象，并且容易導致體內的濕氣情況加重。

喝石斛水也有一定的禁忌，比如用來泡水時劑量不宜過大否則會導致中毒，患者會出現不自主的抽搐，建議患者馬上去醫院就醫。體內濕氣重的患者不宜喝石斛水，因為石斛水具有一定的助濕作用，會加重病情。石斛水不能與發散作用的中藥同時服用，比如薄荷、桂枝、木蘭花、紫蘇葉等，會降低石斛的藥效。另外孕婦最好不喝石斛水，會影響孕婦的身體健康以及胎兒器官的發育。