打hpv疫苗第3針后懷孕，一般情況下不會影響胎兒的發育，可以繼續妊娠，并且按時進行孕檢，在懷孕11周到13周左右進行唐篩檢查，孕期也需要按時進行四維B超檢查胎兒是否存在畸形。

根據你的問題，打了HPV第三針后發現懷孕了，一般是不受影響的，HPV疫苗是類病毒顆粒，沒有使用活病毒，相對來說是比較安全的，所以出現這種情況，不用太擔心，可以繼續妊娠并做好產前檢查。在懷孕11到13周的時候，要做唐氏篩查，22到28周的時候要做三維B超來確定胎兒是否正常。同時要定時，按時做好各種產前檢查。以前醫學界在動物身上的研究并沒有發現，HPV疫苗存在致畸性或者是胎兒的毒性，雖然在人體上并沒有進行這方面的研究，但是臨床醫學并未出現因為注射HPV疫苗導致胎兒生長發育或者是母體健康受到損害的病例出現。但是為了以防萬一，每個國家都禁止備孕階段或者是妊娠階段的女性接種HPV疫苗。