先天性免疫低下
先天性免疫低下的治療，需要根據病情采用不同的措施，一般治療較困難，治療也是長久的，目前對于某些先天性免疫低下也有了行之有效的方法。由于先天性免疫低下多由基因突變引起，因此具有遺傳性。
后天繼發性免疫低下
后天繼發性免疫低下的關鍵是要去除引起免疫低下的原因。許多病毒或細菌感染都可以損害免疫系統，極端的例子是艾滋病。只要能有效清除感染病灶，免疫功能大多會逐步恢復。
治療疾病的藥物種類繁多，其中許多可能影響免疫系統的功能，所以更改或停用引起免疫低下的藥物是關鍵。
營養不良在我們國家的孩子中仍存在(有些可能是患有慢性病引起的)，營養不良不僅會影響到孩子的身體發育、智力發育，同樣也會影響到免疫系統的發育和成熟，引起免疫低下。當然許多情況下，孩子可能由于偏食而造成某類單一營養素的缺乏，如缺乏維生素A、維生素D等等，也會對免疫系統造成影響。
其他許多疾病也可能影響到免疫系統，如先天性心臟病患兒，由于血液供應出現異常，可能引起消化道和呼吸道局部的免疫低下，成為反復呼吸道和消化道感染的原因之一。當心臟畸形校正后，反復感染的情況就會明顯改善。
不管是先天性免疫低下還是后天繼發性免疫低下都需要系統的治療。許多懷疑為免疫低下的孩子往往都是生理性免疫低下，對于這類孩子，正確的認識和處理十分重要。
生理性免疫低下
生理性免疫低下的表現一般沒有上述兩種免疫低下嚴重。感染主要是上呼吸道，如感冒等，而不是肺炎、腦膜炎、敗血癥等嚴重感染。
此外很多孩子往往表現為初入托兒所、幼兒園、學校后容易感冒。這是因為孩子在集體生活中接觸各種細菌、病毒的機會和種類增多。如同有的孩子到了一個新環境后，可能發生心理變化一樣，這需要一個適應過程，一般要一年左右。
生理性的免疫低下是每個人在成長過程中都必須經歷的，是正常現象。因為從嬰兒一出生開始，身體的免疫系統就象身體其他系統一樣，同樣經歷著發育成熟的過程。與成人相比，孩子更容易感冒，這就是因為孩子存在生理性免疫低下。
人類的免疫系統發育成熟與神經系統的發育成熟有許多類似的地方。孩子在不斷“試錯”的過程中，智力才能得到鍛煉，事實上，沒有一個孩子從不犯錯。免疫系統也是一樣，通過不斷與外界物質的接觸，免疫系統也會得到鍛煉，才會正常發育成熟。當然，免疫系統正常的成熟過程每個人可能有區別，而且受到各種身體狀況的影響。因此，有少數孩子免疫低下表現更突出、持續的時間更長，并且得病較重和較頻繁，表現接近病態的免疫低下。這種情況需要一定的醫療指導和適當的治療。
現在，市場上有很多保健類藥物或食品，自稱可以提高兒童的免疫力。這應該說是個好現象，因為說明全社會都普遍關注孩子的問題。但其中不少產品也可能對家長產生誤導。
許多保健品對可以提高免疫力的描述有言過其詞之嫌，缺少嚴格的科學驗證，效果是十分有限的。此外，正如我們前面所述，免疫低下有不同的類型，不同的類型中每個人受影響的環節也各不相同。在不清楚免疫低下類型的前提下，盲目使用提高免疫力的藥物或保健品一來起不到效果，另外還可能造成不良的后果，諸如破壞免疫平衡、引起身體其他異常改變等。事實上，絕大部分生理性免疫低下的兒童并不需要特殊的治療。只要通過加強和平衡孩子的營養、增進體格鍛煉，孩子身體的免疫狀況都會得到明顯改善，能很快適應環境。對于一些免疫低下表現較重的孩子，家長的首要任務是在免疫專科醫生那里明確孩子免疫低下的類型，如果不存在先天性或后天繼發性免疫低下，也可以使用一些藥物治療，但必須在醫生的指導下進行。
