3、營養缺乏
在實驗動物研究中發現小鼠缺乏維生素A、B2及葉酸等食物成分時，可以產生唇腭裂等畸形，而人類是否也會因缺乏此類物質而導致先天性畸形的發生還不十分明確。
所以在妊娠早期的營養缺乏可能是發病誘因之一。
4、感染和損傷
母體在妊娠初期如遭受某種損傷，特別是能夠引起子宮及其鄰近部位的損傷，如不正當的不全人工流產或不科學的藥物墜胎等，都能影響胚胎的發育而招致畸形。
母體罹患病毒感染性疾病如風疹等，也能影響胚胎的發育而成為唇腭裂發生的可能誘因。
5、內分泌的影響
妊娠早期的婦女因患病使用激素治療后出生的嬰兒即有某種先天畸形的發生。此外，在唇腭裂患兒家族史的調查中，也發現有的母親在懷孕早期曾有過各種明顯的精神創傷因素。
推論可能由此而出現應激反應，導致體內腎上腺皮質激素分泌增加，而誘發先天性畸形。
6、藥物因素
多數藥物進入母體后都能通過胎盤進入胚胎。有些藥物可能影響胚胎的發育而造成畸形，目前已知的抗腫瘤藥物如環磷酰胺、氨甲喋呤等。
抗驚厥藥物苯妥英鈉、抗組織胺藥物及治療妊娠性嘔吐的敏克靜和某些安眠藥物如沙立度胺均可導致胎兒畸形。
7、物理損傷
如在胎兒發育時期，孕婦頻繁接觸放射線或微波等均可能影響胎兒的生長發育而成為唇腭裂發生的可能誘因。
8、煙酒因素
妊娠早期大量吸煙及酗酒，其子女唇腭裂的發生率比無煙酒嗜好的婦女要高，因而也是導致胎兒發生唇腭裂的可能因素之一。
為了避免寶寶唇腭裂的發生，孕婦在妊娠期間忌大量吸煙喝酒。孕婦吸煙會使胎兒發育遲緩，體重下降，容易早產或患先天性心臟病，還影響孩子的智力。孕婦酗酒，會使胎兒得胎兒酒精中毒綜合癥，引起胎兒畸形。
