五、消化系統疾病及功能紊亂
懷疑消化系統疾病和口腔潰瘍有著共同的致病菌，因為消化系統和口腔有著密切的關系，究竟口腔潰瘍的發生在消化系統疾病發病之前或者是之后，還有待研究。也有可能和食物反流有關，另外可應用針對消化系統疾病的致病菌如幽門螺桿菌，對口腔潰瘍進行治療，能夠得到良好的效果。
六、營養因素
口腔潰瘍患者有鐵，葉酸，鋅和維生素B1，B2，B6，B12等缺失的問題。
七、內分泌因素
有的女性患者復發性口腔潰瘍與月經周期有關。
八、超氧化物歧化酶活性下降
九、微循環障礙
十、局部因素
多為輕微的創傷。
現代醫學認為，復發性阿弗他潰瘍首先與免疫有著很密切的關系。有的患者表現為免疫缺陷，有的患者則表現為自身免疫反應;其次是與遺傳有關系，在臨床中，復發性阿弗他潰瘍的發病，有明顯的家族遺傳傾向，父母一方或多方若患有復發性阿弗他潰瘍，他們的子女就比一般人更容易患病。
另外，復發性阿弗他潰瘍的發作，還與一些疾病或癥狀有關，比如消化系統疾病：胃潰瘍、十二指腸潰瘍、慢性或遷延性肝炎、結腸炎等，另外偏食、消化不良、發熱、睡眠不足、過度疲勞、工作壓力大、月經周期的改變等等。隨著一種或多種因素的活躍、交替出現機體免疫力下降，致使復發性阿弗他潰瘍的頻繁發作。
