全身系統性疾病
高血壓病、貧血、肺性腦病、中暑等引起頭疼眼睛疼。
顱腦外傷
如腦震蕩、腦挫傷、硬膜下血腫、顱內血腫、腦外傷后遺癥。
毒物及藥物中毒
如酒精、一氧化碳、 有機磷、藥物(如顛茄、水楊酸類)等中毒。
內環境紊亂及精神因素
月經期及絕經期頭疼眼睛疼。神經癥軀體化障礙及癔癥性頭疼眼睛疼。
其他
如頭疼眼睛疼、叢集性頭疼眼睛疼(組胺性頭疼眼睛疼)、頭疼眼睛疼型癲癇。
發病機制頭疼眼睛疼的發病機制復雜，主要是由于顱內、外痛敏結構內的痛覺感受器受到刺激，經痛覺傳導通路傳導到達大腦皮層而引起。
顱內痛敏結構包括靜脈竇(如矢狀竇)、腦膜前動脈及中動脈、顱底硬腦膜、三叉神經(Ⅴ)、舌咽神經(Ⅸ)和迷走神經(Ⅹ)、頸內動脈近端部分及鄰近Willis環分支、腦干中腦導水管周圍灰質和丘腦感覺中繼核等。
顱外痛敏結構包括顱骨骨膜、頭部皮膚、皮下組織、帽狀腱膜、頭頸部肌肉和顱外動脈、第2和第3頸神經、眼、耳、牙齒、鼻竇、口咽部和鼻腔黏膜等。
機械、化學、生物刺激和體內生化改變作用于顱內、外痛敏結構均可引起頭疼眼睛疼。
如顱內、外動脈擴張或受牽拉，顱內靜脈和靜脈竇的移位或受牽引，腦神經和頸神經受到壓迫、牽拉或炎癥刺激，顱、頸部肌肉痙攣、炎癥刺激或創傷，各種原因引起的腦膜刺激，顱內壓異常，顱內5-羥色胺能神經元投射系統功能紊亂等。
病理
生理頭面部血管、神經、腦膜、靜脈竇、頭面部皮膚、皮下組織、粘膜等構成頭部痛敏結構，當其受到機械牽拉、化學、生物刺激或體內內環境發生改變時引發頭部疼痛。
臨床表現
頭疼眼睛疼程度有輕有重，疼痛時間有長有短。疼痛形式多種多樣，常見脹痛、悶痛、撕裂樣痛、電擊樣疼痛、針刺樣痛，部分伴有血管搏動感及頭部緊箍感，以及惡心、嘔吐、頭暈等癥狀。
繼發性頭疼眼睛疼還可伴有其他系統性疾病癥狀或體征，如感染性疾病常伴有發熱，血管病變常伴偏癱、失語等神經功能缺損癥狀等。
