周圍血白細胞數正常，血沉在患病早期稍增快。肺泡滲出液的吞噬細胞內可查見衣原體包涵體。輕癥患兒3～7d發熱漸退。
中癥8～～14d，重癥20～25d退熱。病后免疫力減弱，可復發，有報道復發率達21%，再感染率10%左右。
3.肺炎衣原體肺炎
本癥臨床表現無特異性，與支原體肺炎楥相似。起病緩，病程長，一般癥狀輕，常伴咽、喉炎及鼻竇炎為其特點。
上呼吸道感染癥狀消退后，出現干濕啰音等支氣管炎、肺炎表現。咳嗽癥狀可持續3周以上。
白細胞計數正常，胸片無特異性，多為單側下葉浸潤，表現為節段性肺炎，嚴重者呈廣泛雙側肺炎。
病原學檢查與沙眼衣原體肺炎一樣，從氣管或鼻咽吸取物做細胞培養，肺炎衣原體陽性。
或用熒光結合的肺炎衣原體特異性單克隆抗體來鑒定細胞培養中的肺炎衣原體。
PCR檢測肺炎衣原體DNA較培養更敏感，但用咽拭子標本檢測似不夠理想，不如血清學檢測肺炎衣原體特異性抗體。微量免疫熒光MIF試驗檢測肺炎衣原體仍敏感。
特異性IgM抗體≥1：16或IgM抗體≥1：512或抗體滴度4倍以上增高，有診斷價值。
輕癥可無明顯癥狀。青少年常有聲音嘶啞、干咳、有時發熱、咽痛等咽炎、喉炎、鼻竇炎、中耳炎和支氣管炎等癥狀。
且可持續數周之久，發生肺炎通常為輕型，與肺炎衣原體感染的臨床表現極為相似，并可能伴隨肺外表現如紅斑結節、甲狀腺炎、腦炎和格林-巴利綜合征。
成年人肺炎多較嚴重，特別是老年人往往必須住院和呼吸支持治療。有作者經血清學調查發現肺炎衣原體感染與冠心病之間有關聯，但尚須進一步確定。另外，肺炎衣原體感染發生哮喘的機制亦在研討之中。
