種子含番木瓜甙及芥子酶，前者和芥子甙類似，水解后產生刺激性揮發物。
果實的漿汁對豚鼠子宮有明顯的加強收縮作用，據云種子有墮胎作用，曾用作通經劑及抗刺激劑。
木瓜富有營養，低卡路里，以致對進行減肥的人大有益處。
木瓜有助于治皮外傷或其它外傷;木瓜富有抗炎化合物，也有抗癌作用，對于患骨質疏松癥、關節炎和浮腫的人，好有規律地食用木瓜，同時能夠防癌。
木瓜也能幫助頭皮和頭發的健康，木瓜的攝入量有助于頭發的生長并能防止頭皮屑(頭垢)。
木瓜是有功效排毒方法之一，多吃木瓜酒能排出體內的毒素。
對于患便秘和消化不良的病人，多吃木瓜能減輕病狀。
番木瓜果皮光滑美觀，果肉厚實細致、香氣濃郁、汁水豐多、甜美可口、營養豐富，有“百益之果”、“水果之皇”、“萬壽瓜”之雅稱，是嶺南四大名果之一。
木瓜富含17種以上氨基酸及鈣、鐵等，還含有木瓜蛋白酶、番木瓜堿等。半個中等大小的木瓜足供成人整天所需的維生素C。
木瓜在中國素有“萬壽果”之稱，顧名思義，多吃可延年益壽。
番木瓜用途廣，既是果樹，又是原料作物。成熟的果實，營養豐富，維生素C含量高，可助消化、治胃病。
未成熟的青果，除可作蔬菜食用外，還可腌制、蜜餞，制作果醬和果汁罐頭，又是很好的飼料。
青果含有豐富的木瓜蛋白酶，在醫藥、食品、制革、紡織及美容上廣泛應用，是木瓜酶工業的主要原料。
番木瓜和木瓜的區別主要就是表現在科屬和作用方面，番木瓜就是我們平時吃的木瓜啦。
