預防接種后，絕大多數人能產生抵抗感染的有益的免疫反應，獲得了針對相應傳染病的特異免疫力。但對人的機體而言，疫苗畢竟是異種物質，在進入人體后，機體會產生一系列反應，極個別人在獲得免疫保護的同時，會發生一些除正常反應之外的不良反應。預防接種后的不良反應一方面與疫苗本身所固有的特性有關，另一方面也與受種者自身的體質有關。目前，沒有一種疫苗的接種是絕對安全的，但預防接種不良反應的出現是少見或罕見的。
預防接種不良反應分為兩種，一種是一般反應，常被稱為“正常反應”，主要表現為接種后出現的局部紅腫、疼痛、硬結等癥狀，或有發熱、全身不適、倦怠、食欲不振、乏力等全身癥狀，對機體造成一過性的生理功能障礙。一般反應的病情輕微，恢復較快，多在1～2天內恢復，通常不需要臨床處置。
另一種是異常反應，接種后造成受種者機體組織器官和功能損害，其病情相對較重，多需要臨床處置，但發生極為罕見。不同疫苗的異常反應發生率有所差異，世界衛生組織對部分疫苗的異常反應研究發現，卡介苗引起淋巴結炎、骨髓炎、全身播散癥的發生率分別為100～1000/100萬劑、1～700/100萬劑、2/100萬劑;乙肝疫苗引起的嚴重過敏反應發生率為1～2/100萬劑;含麻疹類疫苗引起的熱性驚厥、血小板減少、嚴重過敏反應的發生率分別為333/100萬劑、33/100萬劑、1～50/100萬劑。破傷風疫苗引起的臂叢神經炎、嚴重過敏反應的發生率分別為5～10/100萬劑和1～6/100萬劑等。由此可見，疫苗引起的異常反應的發生率還是極低的。
