孫祿堂云游歸鄉后，閉門研究武學，并創辦“蒲陽拳社”，使研究與教學互輔，相互印證，得以總結拳理。孫祿堂認為拳術的本質是拳與道合。作為一切拳術的基礎是內勁，即人體內中和之氣的順、逆、合、化。孫祿堂根據易經和丹經先后創立“先后天八卦相合理論”和“以內丹修為為表征的拳學進階理論”。前者揭示出人體內部功能系統間的協調育化與外部運作系統間的對應關系，以及人體生物場與宇宙場之間的對應關系。后者則揭示出拳術修為進階的基礎和本質。因此，孫祿堂根據他的研究對形意拳、八卦拳都進行了提煉和創新。由此產生的孫氏形意拳和孫氏八卦拳都具有深刻而鮮明的內涵和風格---中和。而中和也正是太極拳的本質。

　　雖然那時孫祿堂尚未系統學習太極拳，但他通過對形意拳、八卦拳的深刻掌握和對丹經、易經的深入研究，以及他那登峰造極的內功基礎，使他已經能在內勁上完全修悟到了太極拳的內容。1912年，當孫祿堂與太極拳大師郝為真接觸時，郝為真深感驚訝，對孫祿堂說:“異哉!吾一語而子通悟勝專習數十年者。”(見《拳意述真》陳微明序)其原因就在于，三拳在本質上是相通的。孫祿堂通過對形意、八卦、太極長期深入的研修，感到有創立新拳的必要。其目的是使習拳者少走彎路，速悟拳術之真諦---練出體內一派純正的中和之氣---圓滿的內勁，直至拳道相合的境地。

　　孫祿堂認為形意、八卦、太極是一個有機的拳學整體，三者的關系是互補、互融，并將此精辟地比喻為“天”、“地”、“人”。他說:“三派拳術之道始于一理，中分三派，末復合為一理。其一理者亦各有所得也，形意拳之誠一也，八卦拳之萬法歸一也，太極拳之抱元守一也。”因此，他所創造的孫式太極拳是以太極陰陽互濟，極盡柔順之至為體;在運作的過程中參以內外八卦相合之理，求以動中之靜，內外合一，以極盡中和靈變之妙;在運作的每一時刻，則以形意拳之樁步蘊育體內一觸即發之本能;在運作的狀態上，以“順中用逆，逆中行順”為法則，統馭起鉆落翻之義;在運作的心理上，以無為養神為本，虛中以求中和為用，達致“不求勝人而神行機圓人亦莫能勝之”之能。故孫式太極拳的功能具有如下三大特征:

　　(1)極盡柔順中和之至。

　　(2)極盡靈活巧變之至。

　　(3)極盡整實猛烈之至。